こんにちは
伺いたい事があるのですが・・

離婚し、親権は元妻になりました。
離婚後の苗字変更意はしていません。
最近になり、子供の戸籍が移動されておらず本籍が私の実家のままになっていました。
友達に話したら「普通戸籍移動させると思うけど・・・後々面倒にならないといいけどね〜」と言われました。
子供の戸籍がそのままだと将来的に何か問題が発生することがあるのでしょうか？？

あなたにとって何も問題は発生しません。

通常、元妻の戸籍に移すのは、元妻のほうで
戸籍が子供と一緒のほうが便利だからです。
また、元妻が復氏（結婚前の氏）した場合は、
子供の戸籍を移さないと子供と同じ氏にならない
からです。

あなたから、家庭裁判所に行って、子供の戸籍を
移すよう助言されるといいと思います。
忘れているだけでしょう。

お返事ありがとうございました

こちらに問題が発生しないならそのままにしておきます。